Kementerian Pelajaran Malaysia telah mula melatih guru-guru terpilih tentang  pentaksiran Sekolah Bestari.
Pentaksiran Bestari sedang diserapkan secara berperingkat dimulai dengan Pentaksiran Aptitud Tahun Tiga.
Memandangkan semua sekolah di seluruh negara terlibat, tidak akan timbul ketidakselarasan antara pentaksiran untuk Sekolah Bestari dengan sekolah biasa  yang juga akan menjadi sekolah bestari nanti.